与前作相比，《潜艇总动员：外星宝贝计划》制作水平更加精益求精，并且在角色塑造和故事叙述上有了更大的施展空间，凸显冒险与友情两大教育主题，用寓教于乐的方式，兼顾了家长和孩子两个观影群体的亲子向需求，讲述了小潜艇阿力和贝贝为了给外星宝贝寻找家人，和海底其他的小伙伴踏上了一场海底冒险旅程。该片讲述了热血刑警李红旗（谢苗?饰）由一起疑点重重的社会底层夫妻坠楼案起，调查幕后黑手，意外发现隐藏在东北小城地下的黑恶势力并与之斗争，坚持惩恶扬善、伸张正义的故事。